Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit1Q64282 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms