Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms