Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CochQ62507 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CochQ62507 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms