Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vil1Q62468 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms