Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms