Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrhQ62361 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrhQ62361 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms