Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sall3Q62255 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sall3Q62255 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms