Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms