Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms