Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms