Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp1Q62209 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms