Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sema3cQ62181 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sema3cQ62181 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Sema3cQ62181 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms