Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a2Q62148 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms