Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms