Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Lrrn1Q61809 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lrrn1Q61809 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lrrn1Q61809 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lrrn1Q61809 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lrrn1Q61809 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrn1Q61809 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lrrn1Q61809 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lrrn1Q61809 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lrrn1Q61809 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lrrn1Q61809 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lrrn1Q61809 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lrrn1Q61809 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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