Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms