Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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