Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms