Protein–RNA interactions for Protein: Q61127

Nab2, NGFI-A-binding protein 2, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab2Q61127 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nab2Q61127 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nab2Q61127 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Nab2Q61127 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab2Q61127 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms