Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Cln3Q61124 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Cln3Q61124 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Cln3Q61124 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Cln3Q61124 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Cln3Q61124 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Cln3Q61124 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cln3Q61124 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln3Q61124 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln3Q61124 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln3Q61124 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln3Q61124 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln3Q61124 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln3Q61124 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms