Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim2Q61079 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms