Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms