Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms