Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RelnQ60841 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RelnQ60841 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms