Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms