Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcf4Q60722 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms