Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms