Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms