Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm1Q60636 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms