Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms