Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms