Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms