Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms