Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim41Q5NCC3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms