Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms