Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms