Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms