Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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