Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms