Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms