Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk4Q3V129 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms