Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms