Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Dnah12Q3V0Q1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Dnah12Q3V0Q1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnah12Q3V0Q1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Dnah12Q3V0Q1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Dnah12Q3V0Q1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Dnah12Q3V0Q1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Dnah12Q3V0Q1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Dnah12Q3V0Q1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah12Q3V0Q1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms