Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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