Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms