Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms