Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms