Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms