Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms