Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms